イタリアでの戦争が激化する中、カール・フェアバーンに新たな使命が与えられる。「Alsos Mission」、その内容は敵の原子力兵器の秘密を暴くこと。ドイツがイタリア北部経由で、とある荷物を秘密裏に移送しようとしているとの情報が入った。「Deathstorm: Inception」は3部構成のストーリーの冒頭部分で、カールの大暴れを堪能できる。ドイツ海軍の重要秘密施設に侵入し、無力化せよ。そしてその過程で、カールは同盟軍を脅かしかねない新たな脅威の存在を知ることになる…