『デバッグ彼女』は、ピクセルアートを採用したレトロな2Dアクション ×ノベル × デバッグの新感覚RPGです。ゲームショップで偶然再会した元同級生・佐倉くるみと意気投合したプレイヤー（あなた）は、夏休みの期間を使って新作ゲームの制作を思い立ちます。

彼女はデバッガーとして、あなたが作り出してしまった無数のバグと戦いながら、ゲームの完成度を高めていきます。はたしてゲームは無事完成するのか、そして彼女との関係は･･･？